Em substituição, João Gonçalves Lourenço nomeou Apolinário José Pereira, para o cargo de chefe do Serviço de Inteligência e Segurança Militar (SISM), e Alfredo Eduardo Manuel, para o cargo de comandante-geral da Polícia Nacional (PN).
Com menos de três meses no poder, João Lourenço, já fez 62 exonerações.